53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1209 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  58.35 
 
 
707 aa  825    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  58.77 
 
 
704 aa  857    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  100 
 
 
726 aa  1505    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  62.63 
 
 
700 aa  900    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  55.77 
 
 
728 aa  822    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  52.52 
 
 
693 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  61.35 
 
 
711 aa  912    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  53.85 
 
 
727 aa  801    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  44.19 
 
 
677 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  43.91 
 
 
672 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  41.51 
 
 
701 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  42.05 
 
 
684 aa  532  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  41.33 
 
 
707 aa  529  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  41.23 
 
 
703 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  41.05 
 
 
676 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  41.08 
 
 
703 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  41.08 
 
 
703 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  40.2 
 
 
710 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  40.34 
 
 
710 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  40.06 
 
 
710 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  41.1 
 
 
703 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  41.55 
 
 
697 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  40.06 
 
 
702 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  39.67 
 
 
699 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  40.51 
 
 
727 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  39.63 
 
 
683 aa  504  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  40.66 
 
 
680 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  39.01 
 
 
673 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  39.22 
 
 
682 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  36.63 
 
 
606 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  32 
 
 
1255 aa  292  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  27.88 
 
 
682 aa  257  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  27.25 
 
 
655 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  27.9 
 
 
656 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  26.88 
 
 
659 aa  231  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  26.74 
 
 
656 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  27.26 
 
 
678 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  26.81 
 
 
648 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  26.53 
 
 
647 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  27.44 
 
 
679 aa  210  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.98 
 
 
643 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  24.49 
 
 
615 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  27.45 
 
 
661 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  24.46 
 
 
674 aa  163  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  24.5 
 
 
574 aa  151  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  22.59 
 
 
571 aa  147  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  24.1 
 
 
629 aa  140  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  24.48 
 
 
658 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  24.64 
 
 
630 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  25.04 
 
 
647 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  25.04 
 
 
641 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.67 
 
 
648 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  23.18 
 
 
649 aa  127  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>