53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1420 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  100 
 
 
649 aa  1339    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  32.01 
 
 
629 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  30.88 
 
 
630 aa  241  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  29.27 
 
 
643 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  27.78 
 
 
647 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  27.65 
 
 
682 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  27.99 
 
 
571 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  26.57 
 
 
661 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  28.81 
 
 
574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.85 
 
 
658 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  24.85 
 
 
678 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  24.3 
 
 
659 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  25.38 
 
 
679 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  25.56 
 
 
648 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  25.8 
 
 
656 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  25.99 
 
 
641 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  25.87 
 
 
674 aa  170  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  24.37 
 
 
655 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  24.06 
 
 
656 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  26.04 
 
 
703 aa  157  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  24.83 
 
 
727 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  25.17 
 
 
707 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  23.55 
 
 
693 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  24.93 
 
 
672 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  25.39 
 
 
677 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  23.83 
 
 
697 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  25.53 
 
 
673 aa  146  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  25.29 
 
 
701 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  25.67 
 
 
680 aa  145  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  24.41 
 
 
703 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  24.92 
 
 
648 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  25 
 
 
703 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  25.28 
 
 
647 aa  140  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  25.25 
 
 
676 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  24.19 
 
 
699 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  24.73 
 
 
703 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  24.21 
 
 
710 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  24.17 
 
 
700 aa  138  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  24.41 
 
 
710 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  24.58 
 
 
710 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  25.96 
 
 
682 aa  133  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  24.47 
 
 
702 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  23.67 
 
 
727 aa  130  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  26.14 
 
 
606 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  23.86 
 
 
711 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  23.97 
 
 
684 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  23.18 
 
 
726 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  23.48 
 
 
707 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  23.76 
 
 
728 aa  124  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  23.02 
 
 
704 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  22.19 
 
 
615 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  24.29 
 
 
683 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  22.56 
 
 
1255 aa  62  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>