53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0476 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  48.26 
 
 		 661 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  49.55 
 
 		 658 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  100 
 
 		 643 aa  1300    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  37.08 
 
 		 647 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  38.11 
 
 		 648 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  37.33 
 
 		 674 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  34.97 
 
 		 641 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  36.42 
 
 		 571 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  35.59 
 
 		 574 aa  306  8.000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  30.25 
 
 		 682 aa  230  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  29.24 
 
 		 649 aa  228  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  29.06 
 
 		 647 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.11 
 
 		 656 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  29.01 
 
 		 629 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  26 
 
 		 648 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  24.62 
 
 		 659 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  29.26 
 
 		 677 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  27.42 
 
 		 693 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  25.98 
 
 		 726 aa  190  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  27.41 
 
 		 630 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  26.12 
 
 		 655 aa  188  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  31.01 
 
 		 678 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  25.84 
 
 		 704 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  26.63 
 
 		 707 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  27.17 
 
 		 679 aa  183  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  28.34 
 
 		 682 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  24.46 
 
 		 728 aa  181  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  24.93 
 
 		 672 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  26.65 
 
 		 656 aa  180  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  27.62 
 
 		 680 aa  178  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  29.87 
 
 		 683 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  24.03 
 
 		 700 aa  177  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  26.23 
 
 		 673 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  24.15 
 
 		 711 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  29.02 
 
 		 703 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  25.46 
 
 		 727 aa  165  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  27.79 
 
 		 710 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  27.79 
 
 		 710 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  27.63 
 
 		 710 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  26.53 
 
 		 701 aa  160  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  27.63 
 
 		 702 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  26.68 
 
 		 676 aa  156  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  27.34 
 
 		 707 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  27.13 
 
 		 703 aa  153  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  26.73 
 
 		 699 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  26.69 
 
 		 703 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  27.17 
 
 		 703 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  25.09 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  27.03 
 
 		 684 aa  140  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  25.96 
 
 		 697 aa  137  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  25.44 
 
 		 727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  22.82 
 
 		 615 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  25.96 
 
 		 1255 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>