53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51780 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  50.91 
 
 
710 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  49.71 
 
 
702 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  51.78 
 
 
677 aa  695    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  50.61 
 
 
710 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  48.15 
 
 
672 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  50.53 
 
 
710 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  100 
 
 
673 aa  1394    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  50.15 
 
 
703 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  50.15 
 
 
703 aa  629  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  50.15 
 
 
703 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  50.08 
 
 
699 aa  624  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  48.87 
 
 
697 aa  619  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  48.27 
 
 
707 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  48.78 
 
 
683 aa  609  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  46.72 
 
 
727 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  48.77 
 
 
606 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  47.31 
 
 
684 aa  605  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  47.38 
 
 
703 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  45.63 
 
 
701 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  47.07 
 
 
676 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  44.71 
 
 
693 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  43.95 
 
 
682 aa  545  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  44.95 
 
 
680 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  42.5 
 
 
727 aa  535  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  41.39 
 
 
711 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  41.3 
 
 
704 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  41.74 
 
 
700 aa  524  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  41.13 
 
 
728 aa  519  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  41.83 
 
 
707 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  39.01 
 
 
726 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  34.45 
 
 
1255 aa  304  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  29.88 
 
 
682 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  29 
 
 
659 aa  263  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  29.76 
 
 
647 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  30.47 
 
 
656 aa  246  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  29.06 
 
 
656 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  28.53 
 
 
655 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  30.22 
 
 
648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  27.88 
 
 
678 aa  230  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  28.03 
 
 
679 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  26.82 
 
 
615 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  25.97 
 
 
629 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.57 
 
 
643 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  25.74 
 
 
571 aa  168  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  27.34 
 
 
630 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  25.25 
 
 
674 aa  163  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.13 
 
 
658 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  25.98 
 
 
661 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  27.73 
 
 
574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  25.53 
 
 
649 aa  146  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  25.33 
 
 
641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  22.15 
 
 
647 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  21.79 
 
 
648 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>