53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0790 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  100 
 
 		 661 aa  1371    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  49.29 
 
 		 643 aa  647    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  52.38 
 
 		 658 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  36.66 
 
 		 647 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  37.36 
 
 		 648 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  34.99 
 
 		 674 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  33.97 
 
 		 641 aa  334  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  32.32 
 
 		 571 aa  313  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  32.7 
 
 		 574 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  26.57 
 
 		 649 aa  201  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  26.88 
 
 		 629 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  26.56 
 
 		 682 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  27.73 
 
 		 630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  27.45 
 
 		 726 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  27.66 
 
 		 672 aa  180  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  24.44 
 
 		 678 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  25.64 
 
 		 647 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  27.03 
 
 		 693 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  26.1 
 
 		 648 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  25.72 
 
 		 656 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  26.13 
 
 		 679 aa  170  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  25.45 
 
 		 700 aa  165  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  25.42 
 
 		 707 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  26.1 
 
 		 656 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  25.79 
 
 		 704 aa  164  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  23.43 
 
 		 659 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  26.17 
 
 		 711 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  25.53 
 
 		 701 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  23.64 
 
 		 655 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  25.98 
 
 		 673 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  25.71 
 
 		 727 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  24.97 
 
 		 728 aa  151  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  25.32 
 
 		 677 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  24.57 
 
 		 682 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  26.21 
 
 		 676 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  25.43 
 
 		 710 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  24.46 
 
 		 707 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  25.47 
 
 		 727 aa  132  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  25.12 
 
 		 710 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  25.82 
 
 		 697 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  25.83 
 
 		 703 aa  130  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  23.98 
 
 		 680 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  25.27 
 
 		 710 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  25.12 
 
 		 702 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  24.88 
 
 		 703 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25.7 
 
 		 615 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  24.77 
 
 		 703 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  24.61 
 
 		 703 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  26.39 
 
 		 683 aa  120  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  24.93 
 
 		 684 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  23.58 
 
 		 699 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  24.78 
 
 		 606 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  23.21 
 
 		 1255 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>