53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2360 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  100 
 
 		 679 aa  1407    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  49.4 
 
 		 678 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  44.22 
 
 		 656 aa  600  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  42.28 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  42 
 
 		 659 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  41.17 
 
 		 648 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  39.02 
 
 		 655 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  38.71 
 
 		 656 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  31.61 
 
 		 682 aa  312  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  30.39 
 
 		 697 aa  267  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  30.87 
 
 		 571 aa  260  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  29.41 
 
 		 693 aa  250  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  29.74 
 
 		 684 aa  247  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  29.61 
 
 		 701 aa  246  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  28.19 
 
 		 707 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  29.16 
 
 		 699 aa  239  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  27.94 
 
 		 727 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  28.98 
 
 		 710 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  30.01 
 
 		 710 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  30.16 
 
 		 710 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  28.41 
 
 		 672 aa  237  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  29.83 
 
 		 702 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  28.79 
 
 		 703 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  27.73 
 
 		 676 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  28.65 
 
 		 703 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  28.37 
 
 		 703 aa  231  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  29.37 
 
 		 683 aa  230  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  28.28 
 
 		 574 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  28.03 
 
 		 673 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  27.44 
 
 		 726 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  26.6 
 
 		 703 aa  213  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  26.29 
 
 		 674 aa  213  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  27.88 
 
 		 629 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  27.22 
 
 		 700 aa  208  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  27.81 
 
 		 682 aa  203  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  29.98 
 
 		 677 aa  203  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  26.47 
 
 		 704 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  27.11 
 
 		 711 aa  200  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  26.59 
 
 		 680 aa  200  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  26.17 
 
 		 649 aa  197  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  27.32 
 
 		 606 aa  193  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.18 
 
 		 643 aa  191  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  25.79 
 
 		 728 aa  184  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  26.56 
 
 		 707 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  26.09 
 
 		 661 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  27.49 
 
 		 630 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  26.06 
 
 		 615 aa  177  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  26.33 
 
 		 727 aa  176  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.71 
 
 		 658 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  23.99 
 
 		 641 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  25.69 
 
 		 1255 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  24.53 
 
 		 647 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.43 
 
 		 648 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>