53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2002 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  72.54 
 
 		 703 aa  1066    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  73.42 
 
 		 702 aa  1048    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  69.32 
 
 		 707 aa  1035    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  70.32 
 
 		 710 aa  1050    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  60.57 
 
 		 676 aa  841    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  72.54 
 
 		 703 aa  1063    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  56.36 
 
 		 703 aa  769    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  74.86 
 
 		 697 aa  1105    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  72.25 
 
 		 703 aa  1058    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  50.98 
 
 		 683 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  100 
 
 		 727 aa  1507    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  48.31 
 
 		 677 aa  658    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  70.51 
 
 		 710 aa  1051    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  71.05 
 
 		 699 aa  1040    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  66.57 
 
 		 684 aa  962    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  70.75 
 
 		 710 aa  1053    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  48.16 
 
 		 682 aa  634  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  48.48 
 
 		 680 aa  625  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  44.93 
 
 		 672 aa  608  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  46.72 
 
 		 673 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  44.04 
 
 		 701 aa  565  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  45.01 
 
 		 693 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  40.19 
 
 		 700 aa  521  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  42.56 
 
 		 606 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  40.51 
 
 		 726 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  40.39 
 
 		 711 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  38.6 
 
 		 727 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  39.5 
 
 		 707 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  38.16 
 
 		 704 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  37.02 
 
 		 728 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  31.8 
 
 		 682 aa  267  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  33.33 
 
 		 1255 aa  264  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  30.39 
 
 		 656 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  30.72 
 
 		 647 aa  260  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  29.06 
 
 		 655 aa  250  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  31.26 
 
 		 648 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  26.71 
 
 		 659 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  28.14 
 
 		 678 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  27.94 
 
 		 679 aa  234  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  27.32 
 
 		 656 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25.74 
 
 		 615 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  27.07 
 
 		 571 aa  158  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  26.61 
 
 		 630 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.83 
 
 		 649 aa  155  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  24.64 
 
 		 629 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.95 
 
 		 658 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.44 
 
 		 643 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  30.13 
 
 		 574 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  25.47 
 
 		 661 aa  132  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  23.01 
 
 		 674 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.89 
 
 		 641 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  25 
 
 		 648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  23.55 
 
 		 647 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>