53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2017 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  49.56 
 
 
682 aa  664    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  100 
 
 
702 aa  1455    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  54.01 
 
 
683 aa  720    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  49.71 
 
 
673 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  96.9 
 
 
710 aa  1422    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  87.18 
 
 
699 aa  1293    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  95.21 
 
 
710 aa  1399    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  48.09 
 
 
672 aa  663    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  72.19 
 
 
707 aa  1055    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  96.2 
 
 
710 aa  1412    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  63.81 
 
 
676 aa  875    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  84.74 
 
 
703 aa  1261    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  72.75 
 
 
697 aa  1043    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  65.68 
 
 
684 aa  947    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  50.97 
 
 
677 aa  690    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  73.42 
 
 
727 aa  1048    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  50.46 
 
 
680 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  87.04 
 
 
703 aa  1261    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  87.04 
 
 
703 aa  1258    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  57.87 
 
 
703 aa  794    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  44.87 
 
 
693 aa  565  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  44.02 
 
 
701 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  45.12 
 
 
606 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  41.49 
 
 
700 aa  538  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  40.06 
 
 
726 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  38.43 
 
 
727 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  39.74 
 
 
711 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  39.05 
 
 
707 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  36.36 
 
 
704 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  37.3 
 
 
728 aa  453  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  35.95 
 
 
1255 aa  300  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  30.69 
 
 
682 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  29.87 
 
 
678 aa  251  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  27.47 
 
 
659 aa  243  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  28.83 
 
 
655 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  29.67 
 
 
647 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.44 
 
 
656 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  28.19 
 
 
656 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  29.83 
 
 
679 aa  227  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  29.49 
 
 
648 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25.66 
 
 
615 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  26.07 
 
 
630 aa  160  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.61 
 
 
658 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.63 
 
 
643 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  27.36 
 
 
571 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  23.86 
 
 
629 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  23.88 
 
 
574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.47 
 
 
649 aa  131  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  25.12 
 
 
661 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  23.87 
 
 
674 aa  124  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  23.64 
 
 
641 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.92 
 
 
648 aa  97.4  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  22.83 
 
 
647 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>