53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0590 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  60.49 
 
 		 703 aa  824    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  51.64 
 
 		 677 aa  713    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  47.73 
 
 		 672 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  65.83 
 
 		 710 aa  952    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  65.28 
 
 		 699 aa  943    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  65.98 
 
 		 710 aa  953    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  53.41 
 
 		 683 aa  702    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  66.37 
 
 		 707 aa  936    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  65.98 
 
 		 710 aa  953    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  63.61 
 
 		 676 aa  872    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  66.17 
 
 		 703 aa  954    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  65.73 
 
 		 697 aa  944    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  65.73 
 
 		 703 aa  947    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  66.32 
 
 		 703 aa  956    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  50.08 
 
 		 680 aa  641    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  66.57 
 
 		 727 aa  962    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  65.68 
 
 		 702 aa  947    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  100 
 
 		 684 aa  1416    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  48.76 
 
 		 682 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  47.31 
 
 		 673 aa  605  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  47.34 
 
 		 701 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  44.9 
 
 		 693 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  46.55 
 
 		 606 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  42.05 
 
 		 726 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  40.59 
 
 		 700 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  40.28 
 
 		 711 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  39.46 
 
 		 727 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  40.33 
 
 		 707 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  39.46 
 
 		 704 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  38.02 
 
 		 728 aa  465  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  31.96 
 
 		 682 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  28.69 
 
 		 659 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  33.39 
 
 		 1255 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  30.11 
 
 		 655 aa  263  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  30.26 
 
 		 647 aa  260  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.41 
 
 		 656 aa  257  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  28.59 
 
 		 656 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  28.57 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  29.74 
 
 		 679 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  28.67 
 
 		 678 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25.9 
 
 		 615 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  25.29 
 
 		 629 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  25.95 
 
 		 630 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  24.71 
 
 		 674 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.03 
 
 		 643 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  25.45 
 
 		 574 aa  138  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  24.78 
 
 		 571 aa  134  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  23.97 
 
 		 649 aa  127  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.48 
 
 		 658 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  24.93 
 
 		 661 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  24.4 
 
 		 648 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  22.79 
 
 		 641 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  23.72 
 
 		 647 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>