53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1628 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  49.03 
 
 
679 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  100 
 
 
678 aa  1404    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  48.36 
 
 
656 aa  633  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  43.5 
 
 
647 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  44.08 
 
 
648 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  40.72 
 
 
659 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  39.17 
 
 
655 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  37.98 
 
 
656 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  32.24 
 
 
682 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  29.99 
 
 
693 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  28.63 
 
 
697 aa  260  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  29.99 
 
 
701 aa  257  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  30.03 
 
 
710 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  30.56 
 
 
571 aa  253  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  29.47 
 
 
710 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  29.67 
 
 
710 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  29.87 
 
 
702 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  29.67 
 
 
699 aa  247  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  28.99 
 
 
703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  28.99 
 
 
703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  27.73 
 
 
700 aa  244  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  27.31 
 
 
672 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  28.75 
 
 
703 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  36.52 
 
 
574 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  28.14 
 
 
727 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  28.67 
 
 
684 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  27.88 
 
 
673 aa  230  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  28.01 
 
 
683 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  27.26 
 
 
707 aa  226  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  27.26 
 
 
726 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  26.65 
 
 
674 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  28.16 
 
 
704 aa  224  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  27.44 
 
 
677 aa  220  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  26.86 
 
 
629 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  28.43 
 
 
711 aa  217  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  28.18 
 
 
676 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  27.37 
 
 
707 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  26.37 
 
 
682 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  27.52 
 
 
606 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  27.61 
 
 
703 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  25.65 
 
 
728 aa  203  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  27.25 
 
 
680 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  26.65 
 
 
727 aa  198  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  28.03 
 
 
630 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.85 
 
 
649 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  31.01 
 
 
643 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  24.44 
 
 
661 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  30.79 
 
 
658 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25.11 
 
 
615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  23.9 
 
 
641 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  26.07 
 
 
1255 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  24.16 
 
 
647 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.59 
 
 
648 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>