53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1876 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  98.15 
 
 		 703 aa  1437    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  86.08 
 
 		 710 aa  1273    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  88.29 
 
 		 699 aa  1285    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  47.13 
 
 		 672 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  85.94 
 
 		 710 aa  1273    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  53.25 
 
 		 683 aa  707    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  87.04 
 
 		 702 aa  1261    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  72.22 
 
 		 707 aa  1062    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  85.51 
 
 		 710 aa  1268    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  65.32 
 
 		 676 aa  882    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  58.17 
 
 		 703 aa  800    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  72.71 
 
 		 697 aa  1055    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  99.15 
 
 		 703 aa  1446    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  100 
 
 		 703 aa  1459    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  51.22 
 
 		 680 aa  664    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  72.54 
 
 		 727 aa  1066    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  50.22 
 
 		 677 aa  690    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  66.32 
 
 		 684 aa  956    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  49.14 
 
 		 682 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  50.15 
 
 		 673 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  45.26 
 
 		 693 aa  581  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  45.83 
 
 		 701 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  45.6 
 
 		 606 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  41.74 
 
 		 700 aa  539  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  41.08 
 
 		 726 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  40.79 
 
 		 711 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  39.22 
 
 		 727 aa  510  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  38.98 
 
 		 707 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  38.23 
 
 		 728 aa  475  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  36.89 
 
 		 704 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  35.79 
 
 		 1255 aa  300  8e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  30.6 
 
 		 682 aa  260  7e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 647 aa  257  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  27.35 
 
 		 659 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.61 
 
 		 656 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  28.97 
 
 		 655 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  28.75 
 
 		 678 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  30.62 
 
 		 648 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  27.67 
 
 		 656 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  28.79 
 
 		 679 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  26.31 
 
 		 615 aa  205  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  26.6 
 
 		 571 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  25.91 
 
 		 630 aa  154  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.51 
 
 		 658 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.3 
 
 		 643 aa  150  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  23.89 
 
 		 629 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  25 
 
 		 649 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  24.02 
 
 		 574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  25.08 
 
 		 674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  24.77 
 
 		 661 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.09 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.17 
 
 		 648 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  21.97 
 
 		 647 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>