53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1876 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  58.09 
 
 		 703 aa  803    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  50 
 
 		 677 aa  684    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  48.6 
 
 		 672 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  71.69 
 
 		 710 aa  1066    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  69.15 
 
 		 699 aa  1035    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  71.69 
 
 		 710 aa  1068    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  53.93 
 
 		 683 aa  711    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  100 
 
 		 707 aa  1467    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  71.13 
 
 		 710 aa  1061    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  63.2 
 
 		 676 aa  873    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  72.14 
 
 		 703 aa  1064    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  74.49 
 
 		 697 aa  1065    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  71.94 
 
 		 703 aa  1053    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  72.22 
 
 		 703 aa  1062    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  50.53 
 
 		 680 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  69.32 
 
 		 727 aa  1035    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  72.19 
 
 		 702 aa  1055    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  66.37 
 
 		 684 aa  936    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  49.05 
 
 		 682 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  48.27 
 
 		 673 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  45.72 
 
 		 701 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  45.48 
 
 		 693 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  41.7 
 
 		 700 aa  532  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  41.33 
 
 		 726 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  42.97 
 
 		 606 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  38.65 
 
 		 727 aa  509  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  40.23 
 
 		 711 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  39.69 
 
 		 707 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  38.46 
 
 		 728 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  37.13 
 
 		 704 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  35.52 
 
 		 1255 aa  303  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  29.97 
 
 		 682 aa  267  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  29.55 
 
 		 655 aa  263  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  27.83 
 
 		 659 aa  256  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.65 
 
 		 656 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  29.68 
 
 		 647 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  28.19 
 
 		 679 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  27.6 
 
 		 656 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  29.77 
 
 		 648 aa  238  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  27.26 
 
 		 678 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  26.22 
 
 		 615 aa  206  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  28.03 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  25.66 
 
 		 629 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  25.72 
 
 		 630 aa  164  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  25.3 
 
 		 574 aa  160  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  25.17 
 
 		 649 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.94 
 
 		 643 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.43 
 
 		 658 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  24.46 
 
 		 661 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  22.17 
 
 		 674 aa  122  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  23.52 
 
 		 641 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  22.4 
 
 		 647 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.43 
 
 		 648 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>