53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0185 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  74.78 
 
 
682 aa  1061    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  49.19 
 
 
699 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  49.56 
 
 
710 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  49.56 
 
 
710 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  52.74 
 
 
683 aa  691    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  49.41 
 
 
702 aa  656    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  49.71 
 
 
707 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  49.26 
 
 
710 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  50.37 
 
 
703 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  51.19 
 
 
703 aa  676    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  50 
 
 
703 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  50.44 
 
 
703 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  100 
 
 
680 aa  1392    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  49.04 
 
 
684 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  49.26 
 
 
697 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  50.22 
 
 
676 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  47.94 
 
 
727 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  47.08 
 
 
677 aa  625  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  43.92 
 
 
672 aa  592  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  44.49 
 
 
673 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  42.99 
 
 
701 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  40.66 
 
 
726 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  39.03 
 
 
700 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  39.6 
 
 
693 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  40.49 
 
 
707 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  41.45 
 
 
606 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  38.46 
 
 
704 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  37.2 
 
 
728 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  38.26 
 
 
727 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  39.22 
 
 
711 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  34.62 
 
 
1255 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  29.14 
 
 
682 aa  253  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  28.33 
 
 
656 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  26.13 
 
 
659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  27.11 
 
 
655 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.04 
 
 
656 aa  220  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  28.24 
 
 
648 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  26.29 
 
 
647 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  27.46 
 
 
678 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  26.65 
 
 
615 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  26.7 
 
 
679 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.62 
 
 
643 aa  178  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  27.66 
 
 
571 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  27.31 
 
 
630 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  26.28 
 
 
629 aa  160  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  25.39 
 
 
674 aa  147  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  25.42 
 
 
649 aa  147  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  24.65 
 
 
658 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  26.39 
 
 
574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  24.45 
 
 
661 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.11 
 
 
641 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.46 
 
 
648 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  22.08 
 
 
647 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>