53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1419 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  72.07 
 
 		 647 aa  996    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  100 
 
 		 648 aa  1338    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  38.17 
 
 		 643 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  36.93 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  37.36 
 
 		 661 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  32.2 
 
 		 674 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  30.02 
 
 		 641 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  30.34 
 
 		 574 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  30.96 
 
 		 571 aa  240  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  25.97 
 
 		 682 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.92 
 
 		 649 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  25.29 
 
 		 701 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  24.01 
 
 		 647 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  26.13 
 
 		 648 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  23.55 
 
 		 659 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  24.84 
 
 		 656 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  23.97 
 
 		 656 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  23.59 
 
 		 678 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  23.67 
 
 		 726 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  24.85 
 
 		 672 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  24.22 
 
 		 727 aa  130  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  24.71 
 
 		 707 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  26.33 
 
 		 629 aa  127  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  24.92 
 
 		 655 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  23.43 
 
 		 679 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  25.04 
 
 		 693 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  24.68 
 
 		 704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  25.07 
 
 		 703 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  23.37 
 
 		 700 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  25.46 
 
 		 697 aa  120  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  25 
 
 		 727 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  23.11 
 
 		 711 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  23.7 
 
 		 677 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  23.12 
 
 		 680 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  22.59 
 
 		 728 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  23.37 
 
 		 682 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  24.4 
 
 		 684 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  23.69 
 
 		 676 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  21.79 
 
 		 673 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  23.43 
 
 		 707 aa  99.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  24.18 
 
 		 710 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  23.92 
 
 		 702 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  24.03 
 
 		 710 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  22.9 
 
 		 703 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  22.77 
 
 		 703 aa  97.1  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  23.17 
 
 		 703 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  24.07 
 
 		 710 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  23.69 
 
 		 606 aa  94.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  24.3 
 
 		 630 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  23.39 
 
 		 699 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  21.46 
 
 		 683 aa  75.1  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  24.04 
 
 		 1255 aa  73.9  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  19.51 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>