More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15110 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15110  predicted flavoprotein  100 
 
 		 446 aa  908    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.275464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1017  HI0933 family protein  42.68 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.448898  normal  0.281024 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12200  predicted flavoprotein  36.06 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  33.18 
 
 		 413 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0944  HI0933 family protein  33.76 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.354418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  32.68 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  31.73 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  30.66 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  30.28 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  29.81 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  28.82 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  28.64 
 
 		 396 aa  172  9e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  29.4 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  30.52 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  29.29 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1505  HI0933 family protein  30.31 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000535325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  28.54 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  28.54 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  28.26 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  28.3 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  27.95 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  27.82 
 
 		 394 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  26.39 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  29.82 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  27.71 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  27.99 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  27.58 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  28.1 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  27.99 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  27.19 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  27.48 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  28.19 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  27.71 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  28.4 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  28.77 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  28.4 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  28.33 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  27.92 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  27.15 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  27.62 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.47 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  29.1 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.47 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  26.24 
 
 		 393 aa  146  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  26.67 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  26.73 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  27.64 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  27.69 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  27.69 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  29.66 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  25.81 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  27.69 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  27.69 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  27.69 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  27.69 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  27.69 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  26.67 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  27.7 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  26.13 
 
 		 446 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  26.03 
 
 		 409 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  25.24 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  26.74 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  27.45 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  29.98 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  26.67 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  28.25 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  27.53 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  27.14 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  25.56 
 
 		 401 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  27.12 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  27.36 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  27.23 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  25.94 
 
 		 424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  27.07 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  27.36 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  27.82 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  26.04 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  26.99 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  26.72 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  26.92 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  25.71 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  25.71 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  26.15 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2439  hypothetical protein  26.46 
 
 		 397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  26.99 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  27.6 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  26.75 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  28.32 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  28.01 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  24.94 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  28.32 
 
 		 460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  27.54 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  26.19 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  23.95 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  26 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  25.88 
 
 		 394 aa  130  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  26.88 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.57 
 
 		 413 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>