46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2332 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  829    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  69.32 
 
 		 414 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  41.58 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  26.53 
 
 		 376 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  29.4 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  28.73 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  27.35 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  28.43 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  28.45 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  30.42 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  28.45 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  28.18 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  28.62 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  28.73 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  27.09 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  26.45 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  27.73 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  27.62 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  26.88 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  26.56 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  26.67 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  27.67 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  25.7 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  26.56 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  25.67 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  26.48 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  29.43 
 
 		 375 aa  99.8  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  26.52 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  26.05 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  24.93 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  35.22 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  26.04 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  24.46 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  24.93 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  22.87 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  29.49 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  23.88 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  20.78 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  28.67 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  22.29 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  22.88 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  25.81 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  27.27 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  23.42 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  25.44 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  21.48 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>