39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0607 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  728    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  81.84 
 
 		 358 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  81.28 
 
 		 358 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  81.56 
 
 		 358 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  73.28 
 
 		 361 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  30.43 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  30.02 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  30.92 
 
 		 392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  29.89 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  28.36 
 
 		 384 aa  135  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  43.86 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  43.86 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  43.27 
 
 		 392 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  27.8 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  28.09 
 
 		 375 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  27.51 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  25.45 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  26.48 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  24.56 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  28.65 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  25.27 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  26.75 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  26.92 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  24.8 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  26.11 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  25.47 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  23.96 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  26.64 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  26.69 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  21.76 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  24.11 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  21.14 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  23.72 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  22.26 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  23.06 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  35.56 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  23.2 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  26.4 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  27.91 
 
 		 432 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>