34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2583 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  890    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  31.67 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  28.85 
 
 		 437 aa  169  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  30.02 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  27.23 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  25.7 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  26.86 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  25.35 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  26.83 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  26.67 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  25.91 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  25.14 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  24.26 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  33.51 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  26.22 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  24.52 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  24.46 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  23.94 
 
 		 393 aa  67  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  28.16 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  22.2 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  20.77 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  26.87 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  24.75 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  24.26 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  27.33 
 
 		 363 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  25.74 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  28.43 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  21.52 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  21.52 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  22.92 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  21.27 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  27.69 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  20.8 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  21.5 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>