43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4106 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  63.41 
 
 		 399 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  49.24 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  41.25 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  36.56 
 
 		 388 aa  256  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  28.64 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  30.56 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  27.27 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  28.73 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  26 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  26.26 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  27.45 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  25.71 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  24.43 
 
 		 447 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  25.27 
 
 		 358 aa  93.6  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  24.87 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  26.41 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  25.9 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  26.15 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  26.15 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  34.78 
 
 		 358 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  34.78 
 
 		 358 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  34.78 
 
 		 358 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  24.11 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  24.52 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  22.96 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  24.52 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  21.55 
 
 		 414 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  21.76 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  21.65 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  27.45 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  26.54 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  20.43 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  25.42 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  24.15 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  23.04 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  29.14 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  23.72 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  27.65 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  26.67 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  23.04 
 
 		 367 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  22.35 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  28.21 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>