45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3645 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  818    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  41.33 
 
 
414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  40.1 
 
 
407 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  30.77 
 
 
399 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  29.89 
 
 
375 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  28 
 
 
400 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  30.56 
 
 
396 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  29.48 
 
 
384 aa  123  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  26.65 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  27.14 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  29.5 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  25.89 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  28.16 
 
 
393 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  27.8 
 
 
358 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  26.24 
 
 
415 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  28.16 
 
 
361 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  27.61 
 
 
392 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  27.34 
 
 
358 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  27.61 
 
 
392 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  26.3 
 
 
358 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  27.34 
 
 
358 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  27.32 
 
 
392 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  27.04 
 
 
392 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  26.15 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  26.65 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  26.06 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  25.4 
 
 
367 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  27.16 
 
 
345 aa  93.2  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  27.53 
 
 
397 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  24.87 
 
 
422 aa  89.7  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  23.68 
 
 
447 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  24.73 
 
 
437 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  23.51 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  24.32 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  22.55 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  22.58 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  24.07 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  22.77 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  21.66 
 
 
448 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  26.14 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  32.77 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  32.48 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  23.1 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  27.12 
 
 
421 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  25.86 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>