33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3367 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  100 
 
 
424 aa  858    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  30.14 
 
 
398 aa  136  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  27.17 
 
 
448 aa  106  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  22.98 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  25.55 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  28.43 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  31.74 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  25.99 
 
 
400 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  26.35 
 
 
447 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  28.47 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  22.08 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  23.98 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  33.51 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  22.79 
 
 
384 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  22.19 
 
 
407 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  21.05 
 
 
388 aa  59.7  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  26.14 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  20.68 
 
 
414 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  21.94 
 
 
367 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  22.2 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  29.27 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  26.02 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  22.84 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  22.91 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  29.23 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  21.24 
 
 
363 aa  49.7  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  22.25 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  24.52 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  28.45 
 
 
345 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  27.87 
 
 
352 aa  47.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  19.61 
 
 
396 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  24.11 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  27.83 
 
 
358 aa  43.1  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>