38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1644 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  100 
 
 		 393 aa  798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  64.89 
 
 		 392 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  64.63 
 
 		 392 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  64.89 
 
 		 392 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  64.12 
 
 		 392 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  37.28 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  34.08 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  30.56 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  30.02 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  31.03 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  30.79 
 
 		 358 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  30.54 
 
 		 358 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  29.47 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  26.98 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  27.35 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  28.16 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  28.95 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  27.44 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  23.62 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  24.87 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  31.82 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  25.33 
 
 		 400 aa  89.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  27.02 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  25.78 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  27.06 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  35.33 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  23.94 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  22.09 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  21.13 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  24.17 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  26.8 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  19.19 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  21.52 
 
 		 448 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  30.48 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  30.95 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  21.12 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  22.38 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>