39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02669 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  914    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  34.24 
 
 		 414 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  26.2 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  27.53 
 
 		 422 aa  136  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  29 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  25.75 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  24.88 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  25.84 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  24.66 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  24.43 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  24.23 
 
 		 388 aa  88.2  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  25.91 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  23.68 
 
 		 401 aa  87.8  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  26.57 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  24.88 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  24.61 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  26.61 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  23.36 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  23.84 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  26.02 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  25.33 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  25.95 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  21.87 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  22.45 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  21.13 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  29.75 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  24.66 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  21.57 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  32.26 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  22.26 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  18.29 
 
 		 392 aa  57  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  29.01 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  21.98 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  20.68 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  20.68 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  30.1 
 
 		 367 aa  47.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  26.53 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  24.52 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  20.42 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>