40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0581 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  845    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  43.5 
 
 		 437 aa  344  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  32.4 
 
 		 422 aa  255  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  30.98 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  30.02 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  29.17 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  26.2 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  27.43 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  28.18 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  27.23 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  26.71 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  26.24 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  26.67 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  26.32 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  23.94 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  28.43 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  25.34 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  25.59 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  25.78 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  25.33 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  25.08 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  24.8 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  25.33 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  23.96 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  24.24 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  23.94 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  24.24 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  23.71 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  22.96 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  26.52 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  35.83 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  24.94 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  23.37 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  23.63 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  23.47 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  24.18 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  21.46 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  31.71 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  29.87 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  24.42 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>