40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2872 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  820    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  30 
 
 		 424 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  27.43 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  24.37 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  24.48 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  27.35 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  26.86 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  27.05 
 
 		 437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  28.28 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  28.62 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  24.88 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  27.19 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  22.22 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  22.11 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  27.04 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  22.06 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  24.11 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  23.12 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  22.9 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  25 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  24.68 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  25.16 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  23.77 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  22.05 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  24.21 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  24.21 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  21.65 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  23.72 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  22.7 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  22.82 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  24.08 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  24.46 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  21.95 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  19.19 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  20.1 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  24.31 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  20.48 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  20.48 
 
 		 392 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  25 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>