38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1989 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  100 
 
 		 392 aa  795    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  98.21 
 
 		 392 aa  784    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  98.98 
 
 		 392 aa  789    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  98.72 
 
 		 392 aa  789    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  64.89 
 
 		 393 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  34.38 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  33.67 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  31.14 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  30.92 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  31.83 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  31.33 
 
 		 358 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  31.33 
 
 		 358 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  29.26 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  28.45 
 
 		 407 aa  113  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  28.87 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  26.86 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  27.61 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  26.48 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  26.49 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  26.59 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  28 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  25.06 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  26.41 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  25.33 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  23.6 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  24.53 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  30.66 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  22.25 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  21.27 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  28.08 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  20.48 
 
 		 398 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  28.67 
 
 		 363 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  22.83 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  20.42 
 
 		 447 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>