39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0133 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  753    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  43.86 
 
 		 384 aa  312  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  31.23 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  31.23 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  31.14 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  31.14 
 
 		 392 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  31.14 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  29.56 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  27.65 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  30.72 
 
 		 401 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  27.27 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  30.34 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  29.43 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  27.61 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  27.04 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  28.15 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  26.46 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  26.17 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  24.78 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  28.86 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  28.7 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  29.68 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  25.29 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  25.77 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  26.06 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  21.88 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  23.73 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  35.34 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  24.31 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  22.92 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  24.32 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  24.61 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  26.51 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  22.84 
 
 		 432 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  22.95 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  22.12 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  22.02 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  21.14 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  22.38 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>