40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3513 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  796    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  29.14 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  27.75 
 
 		 415 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  28 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  26.04 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  26.67 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  27.97 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  25.78 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  26.53 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  27.56 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  26.56 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  26.09 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  20.95 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  24.71 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  24.69 
 
 		 358 aa  96.3  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  23.9 
 
 		 447 aa  96.3  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  25 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  26.09 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  25.25 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  25 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  23.82 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  25.99 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  25.84 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  27.12 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  23.1 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  24.51 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  23.76 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  24 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  24.28 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  23.91 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  24.87 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  25.72 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  26.65 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  25.59 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  21.11 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  20.69 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  23.05 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  26.62 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  21.69 
 
 		 363 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  29.86 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>