38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003639 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  100 
 
 
363 aa  751    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  61.31 
 
 
367 aa  471  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  40.69 
 
 
352 aa  275  9e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  41.23 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  25.68 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  26.26 
 
 
401 aa  92.8  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  26.52 
 
 
407 aa  89.4  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  24.94 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  23.12 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  26.64 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  25.69 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  24.94 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  23.21 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  24.53 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  24.1 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  25.87 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  24.91 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  24.11 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  36.57 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  23.37 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  23.97 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  27.39 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  21.58 
 
 
448 aa  63.5  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  21.43 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  20.67 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  25.62 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  27.33 
 
 
432 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  23.72 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  22.52 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  22.55 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  26.79 
 
 
397 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  21.77 
 
 
424 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  28.67 
 
 
392 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  30.95 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  22 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  28.67 
 
 
392 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  28.67 
 
 
392 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  28.67 
 
 
392 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>