38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0620 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  733    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  77.13 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  77.13 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  76.86 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  73.28 
 
 		 358 aa  559  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  32.06 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  31.13 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  28.99 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  29.26 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  29.5 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  29.74 
 
 		 392 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  29.5 
 
 		 392 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  29.47 
 
 		 393 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  28.75 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  30.42 
 
 		 407 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  28.19 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  29.43 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  29.48 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  29.02 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  27.25 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  28.57 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  25.71 
 
 		 396 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  25.96 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  31.07 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  24.28 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  25.79 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  35.83 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  25.69 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  24.68 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  27.61 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  30.49 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  32.26 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  33.62 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  22.81 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  29.45 
 
 		 448 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  22.25 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>