40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0341 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  100 
 
 		 398 aa  814    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  37.28 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  34.38 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  33.98 
 
 		 392 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  33.9 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  33.9 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  29.06 
 
 		 384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  30.07 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  29.89 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  28.99 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  29.92 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  29.64 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  29.64 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  27.67 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  28.73 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  27.95 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  29.5 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  25.43 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  26.43 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  26.79 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  26.26 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  25.62 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  23.22 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  25.32 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  25.08 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  23.65 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  23.19 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  24.46 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  24.3 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  21.98 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  23.81 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  20.67 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  23.38 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  24.41 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  38.27 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  29.23 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  21.98 
 
 		 447 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  23.72 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  28.16 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>