42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4112 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  815    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  45.5 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  43.39 
 
 		 399 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  41.25 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  31.2 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  26.98 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  24.73 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  26.43 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  25.78 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  27.67 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  24.78 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  27.51 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  27.25 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  26.74 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  26.48 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  26.65 
 
 		 401 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  26.48 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  26.48 
 
 		 392 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  26.86 
 
 		 358 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  25.34 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  29.01 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  29.01 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  26.88 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  25.68 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  29.09 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  26.02 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  29.83 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  25.2 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  23.7 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  27.09 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  25.44 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  28.44 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  27.39 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  23.9 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  25.93 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  24.46 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  24.75 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  21.59 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  23.48 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  29.71 
 
 		 424 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  31.19 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  31.33 
 
 		 278 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>