45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1421 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  760    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  26.82 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  28.46 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  28.75 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  29.49 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  25.78 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  28.95 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  29.11 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  29.81 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  27.1 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  25.38 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  26.56 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  27.23 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  26.86 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  27.16 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  27.74 
 
 		 358 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  24.43 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  26.22 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  26.79 
 
 		 398 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  26.94 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  25.45 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  25.68 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  27.04 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  23.19 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  23.44 
 
 		 397 aa  86.3  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  23.98 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  24.52 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  25.07 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  22.7 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  24.72 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  25.44 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  22.91 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  22.25 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  28.16 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  21.46 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  25.95 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  27.53 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  22.01 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  37.76 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  30.77 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  21.49 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  28.86 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  32 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  22.22 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  21.61 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>