40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4121 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  886    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  43.5 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  34.93 
 
 		 422 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  30.79 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  28.47 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  29.51 
 
 		 448 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  30.49 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  28.27 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  26.24 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  26.98 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  25.55 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  24.73 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  24.65 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  23.62 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  23.06 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  23.4 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  27.53 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  25.45 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  25.66 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  25 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  24.26 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  24.29 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  24.47 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  24.07 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  23.87 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  21.83 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  23.96 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  23.96 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  23.72 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  24.73 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  22.09 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  30.49 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  24.22 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  23.38 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  22.8 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  30.73 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  27.06 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  27.47 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  27.13 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  22.35 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>