42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0288 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  706    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  46.65 
 
 		 352 aa  338  9e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  41.23 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  41.08 
 
 		 367 aa  269  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  29.48 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  26.94 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  28.62 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  27.19 
 
 		 358 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  27.19 
 
 		 358 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  28.65 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  27.16 
 
 		 401 aa  92.8  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  35.95 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  35.95 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  26.52 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  23.8 
 
 		 399 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  25.59 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  35.33 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  29.83 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  37.19 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  23.77 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  24.7 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  28.74 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  24.8 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  23.19 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  26.54 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  33.33 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  33.33 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  33.33 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  33.33 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  22.81 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  26.87 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  20.43 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  29.75 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  28.82 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3457  hypothetical protein  29.39 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  31.58 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  27.78 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  27.34 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3367  outer membrane insertion C-terminal signal  28.45 
 
 		 424 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  29.33 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  22.22 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  31.75 
 
 		 407 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>