21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0617 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  830    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  83.12 
 
 		 407 aa  668    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  44.23 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  43.53 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  31.05 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  29.11 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  29.21 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  28.53 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  28.47 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  28.8 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  30.18 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  21.71 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  27.84 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  24.13 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  23.41 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  26.83 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  24.73 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  29.33 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  21.61 
 
 		 376 aa  46.6  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  21.48 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  23.81 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>