22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0616 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  832    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  83.12 
 
 		 405 aa  675    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  44.72 
 
 		 407 aa  313  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  45.5 
 
 		 411 aa  309  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  31.2 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  29.22 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  28.5 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  28.99 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  27.89 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  29.04 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  27.51 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  25.99 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  27.93 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  25.93 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  24.41 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  21.93 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  26.09 
 
 		 393 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  22.16 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  22.88 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  31.1 
 
 		 345 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  27.03 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  24.64 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>