38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2357 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1989  topoisomerase IV, subunit B  98.98 
 
 		 392 aa  789    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000195598  hitchhiker  0.00000000123965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2473  topoisomerase IV, subunit B  98.72 
 
 		 392 aa  785    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000482554  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2357  topoisomerase IV, subunit B  100 
 
 		 392 aa  795    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00373796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2370  topoisomerase IV, subunit B  99.23 
 
 		 392 aa  791    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1644  topoisomerase IV, subunit B  64.89 
 
 		 393 aa  542  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125733  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0341  topoisomerase IV, subunit B  33.9 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  0.195257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01732  gram negative topoisomerase IV, subunit B  33.67 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.014488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0133  hypothetical protein  31.39 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3218  hypothetical protein  31.58 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3075  hypothetical protein  31.08 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1302  hypothetical protein  31.08 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0448197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0620  hypothetical protein  29.5 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0607  hypothetical protein  43.86 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  28.45 
 
 		 407 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  26.56 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  27.89 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  27.61 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  26.48 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01493  hypothetical protein  26.87 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  26.49 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3513  hypothetical protein  25.25 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  27.73 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2858  hypothetical protein  25.3 
 
 		 397 aa  89.7  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  26.15 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0581  hypothetical protein  24.8 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0074321  hitchhiker  0.00948251 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4121  hypothetical protein  24.73 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113239  hitchhiker  0.00815434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3760  hypothetical protein  24.05 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1334  hypothetical protein  24.76 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.558322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2034  hypothetical protein  22.22 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0318  hypothetical protein  30.66 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.547166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2583  hypothetical protein  20.8 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0484  hypothetical protein  28.08 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2872  hypothetical protein  20.48 
 
 		 398 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02209  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02669  hypothetical protein  20.68 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28183  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003639  ABC-type sulfate transport system permease component  28.67 
 
 		 363 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0432  hypothetical protein  22.11 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.706481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>