24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0612 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  833    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  60.77 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  44.99 
 
 		 407 aa  309  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  44.23 
 
 		 405 aa  308  9e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  29.19 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  29.36 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  28.94 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  30.22 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  32.23 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  25.55 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  24.41 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  23.77 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  22.89 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  32.9 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  33.57 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  27.36 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  29.3 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  29.14 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  29.03 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  32.77 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  23.42 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4110  hypothetical protein  29.41 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  25.63 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  21.62 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>