18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0571 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  46.77 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  43.94 
 
 		 390 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  45 
 
 		 398 aa  332  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  31.79 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  31.74 
 
 		 430 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  31.87 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  30.75 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  32.35 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  28.13 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  26.4 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  22.49 
 
 		 421 aa  89.7  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  24.17 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  26.47 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  23.6 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  23.24 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  22.31 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  21.93 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>