18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3976 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  805    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  68.67 
 
 		 390 aa  564  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  50.39 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  46.77 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  31.02 
 
 		 415 aa  166  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  29.44 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  28.17 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  30.35 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  27.92 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  28.61 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  26.49 
 
 		 421 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  28.24 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  24.29 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  25 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  21.71 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  25.3 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  27.45 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  20.17 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>