21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1999 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  863    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  73.22 
 
 		 426 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  31.55 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  29.98 
 
 		 411 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  28.91 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  29.21 
 
 		 405 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  28.94 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  26.35 
 
 		 393 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  27.74 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  27.09 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  23.71 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  24.71 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  23.39 
 
 		 398 aa  96.7  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  25.82 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  22.64 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  25.91 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  22.41 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  28.86 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  23.23 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0425  hypothetical protein  30.56 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000166547  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  27.12 
 
 		 401 aa  43.1  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>