17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0059 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  812    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  42.18 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  40.92 
 
 		 391 aa  310  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  30.91 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  28.39 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  29.54 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  29.3 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  27.88 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  28.19 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  27.95 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  27.06 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  23.93 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  23.6 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  24.74 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  25.75 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  20.9 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  23.58 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>