17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3228 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  807    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  50.92 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  51.49 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  45.68 
 
 		 383 aa  329  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  30.64 
 
 		 430 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  28.79 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  28.35 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  27.88 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  29.09 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  28.16 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  27.2 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  25.06 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  23.39 
 
 		 421 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  26.62 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  32.9 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  28.31 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  27.62 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>