24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1956 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  852    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  52.11 
 
 
402 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  43.8 
 
 
384 aa  295  9e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  31.55 
 
 
393 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  29.86 
 
 
430 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  31.9 
 
 
383 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  29.32 
 
 
390 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  30.35 
 
 
393 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  30.08 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  29.86 
 
 
426 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  28.47 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  28.64 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  27.5 
 
 
391 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  29.04 
 
 
407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  28.8 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  36.36 
 
 
411 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  22.36 
 
 
427 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  37.14 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4108  hypothetical protein  27.52 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4112  hypothetical protein  31.19 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4106  hypothetical protein  27.74 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  21.54 
 
 
401 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  25.2 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2159  phosphate-selective porin O and P  34.83 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>