18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1108 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  775    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  43.3 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  43.8 
 
 		 415 aa  276  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  30.08 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  32.16 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  30.35 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  28.79 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  28.03 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  29.82 
 
 		 403 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  27.95 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  27.23 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  29.59 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  26.85 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  25.55 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  27.45 
 
 		 411 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  25.82 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  27.57 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  21.76 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>