23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1997 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  868    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  73.22 
 
 
421 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  31.04 
 
 
403 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  30.89 
 
 
411 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  31.05 
 
 
405 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  31.55 
 
 
407 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  29.36 
 
 
407 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  29.41 
 
 
415 aa  131  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  26.98 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  28.05 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  23.89 
 
 
390 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  25.06 
 
 
398 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  25 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  26.85 
 
 
384 aa  94.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  23.95 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  26.02 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  22.14 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  30.77 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  20.48 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  25.81 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0905  hypothetical protein  24.69 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1599  hypothetical protein  23.64 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000652534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3645  hypothetical protein  25.86 
 
 
401 aa  43.1  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>