18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4138 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  801    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  69.35 
 
 		 393 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  50.92 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  43.94 
 
 		 383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  30.08 
 
 		 384 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  30.18 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  29.04 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  28.57 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  28.5 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  28.27 
 
 		 415 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  23.71 
 
 		 421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  25.76 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  23.89 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  23.97 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  27.04 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  25.79 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  22.89 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  20.33 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>