150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1351 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1351  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 268 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0206  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4527  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26232  predicted protein  24.07 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.147074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5224  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164951  normal  0.667008 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.15 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.15 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.15 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5487  hypothetical protein  27.75 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324647  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  24.71 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  25.23 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  26.83 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.51 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  23.72 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  23.66 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  26.74 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  25.12 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  22.52 
 
 		 273 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  25.36 
 
 		 396 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  23.76 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  24.4 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  30.88 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  24.4 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  24.4 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0382  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  21.35 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  23.9 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  23.2 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.77 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  23.9 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  23.9 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  22.65 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.26 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  22.75 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  22.44 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  24.64 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  25.65 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  24.39 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1929  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  27.04 
 
 		 397 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  23.15 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  21.72 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  23.62 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  30.56 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  25.12 
 
 		 397 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  23.18 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.05 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  22.8 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  21.24 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  22.52 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  20.56 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  24.16 
 
 		 360 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0319  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  21.34 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  20.54 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  24.47 
 
 		 267 aa  45.4  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  27.14 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  21.91 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.32 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  24.54 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  23.79 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>