158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0206 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0206  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 259 aa  500  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  45.92 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1351  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4527  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0382  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.23 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415883  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26232  predicted protein  30.7 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0319  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.42 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.45 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  32.27 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  33.17 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.09 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.09 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.09 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.38 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  30.41 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  27.55 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.08 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  32.52 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  33.01 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.99 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 393 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  29.85 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.17 
 
 		 277 aa  52.4  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 373 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.06 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.57 
 
 		 425 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  44.12 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  30.1 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  31.75 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.68 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.66 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.74 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.86 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  29.69 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 396 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  29.95 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  44.12 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  28.69 
 
 		 393 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  31.11 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  30.73 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  29.38 
 
 		 377 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  31.09 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  37.08 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  31.77 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 		 360 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 343 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  31.34 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.86 
 
 		 282 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5487  hypothetical protein  32.81 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324647  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3427  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8230  alpha/beta hydrolase fold protein  31.17 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>